田七（张达明 饰）是个精人，常喝醉打妻子当归（蔡少芬 饰），当归痛定思痛发誓要对夫报复，刚巧城中富商罗汉果欲寻名医，当归于是谎称丈夫会医术，并且要用精棍子揍田七，他才会应允他人治医，罗汉果信以为真，不但将田七痛打一顿，并将其接入家中，于是一场啼笑皆非的闹剧开始了……
毕业前夕，以逆转心衰为己任的王扬鸣因与导师在医学实验上发生分歧，毅然决定从科研转向临床，并顺利入职了全国心血管排名第一的瑞仁医院急诊科。忙碌的急诊科生活激起了王扬鸣的竞争本能，他冒险处理老人室颤，解救热射病农民工，救治脑中风病人，不断精进医术，并与胖子路易、祖闻达和刘非组成了患难与共的“急诊四杰”。四人相互见证了彼此的成长和改变，收获了友情爱情，也经历了聚散离合，但不变的是：哪里有最危重的病人，他们就会出现在哪里。当王扬鸣面对医疗生涯中最棘手的心脏病人，四杰重新相聚，同战困难，终获成功。
影片背景设置在11世纪的波斯，一位英国人为了学习医术掩盖其天主教徒的身体，加入了伊斯巴罕一所只招收犹太人的医学院。他治随的老师名叫阿维森纳，是历史上著名的犹太科学家、思想家和医生。阿维森纳的著作达200多种，最著名的有《哲学、科学大全》，在当时是高水平的百科全书；另一部 巨著是《医典》，直到17世纪西方国家还视为医学经典，至今仍有参考价值。《神医》结合史诗与虚构，展现了在那个被愚昧和迷信统治的世纪里一群人探索真知的无畏精神。