学生们学会了运用魔法，校园内弥漫着欢声笑语，整个校园仿佛被一层神秘的光晕所笼罩，魔法气息弥漫其中。山脉的深处隐藏着一个神秘的洞穴，内有碧绿的溪流和神奇的灵芝。上世纪四十年代，抗日战争胜利在望，却又迎来了一场更为隐秘的谍战风暴。少年眉宇间透着英气，目光犀利如刀，手中握着一柄闪闪发光的宝剑。“我一直在等你，你知道这是为什么吗？”女子语带哀伤地说道。小智带领其他志愿者在基地里研究外星科技，策划反击作战，最终成功制造出能够抵御外星人进攻的超级武器。